Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PUS3Q9BZE2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PUS3Q9BZE2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PUS3Q9BZE2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms