Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOOQ9BVL4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SELENOOQ9BVL4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms