Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC32Q9BV29 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC32Q9BV29 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.9 ms