Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DUSP9Q99956 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP9Q99956 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms