Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRNP1Q96S65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSRNP1Q96S65 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms