Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC1Q96MU7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
YTHDC1Q96MU7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms