Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APIPQ96GX9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APIPQ96GX9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APIPQ96GX9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291 ms