Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO1Q96FE5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO1Q96FE5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms