Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM11Q96F44 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM11Q96F44 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM11Q96F44 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms