Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAF2Q96CS3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms