Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDF1Q96CC6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDF1Q96CC6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms