Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6NLQ92738 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP6NLQ92738 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6NLQ92738 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms