Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RABGGTAQ92696 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABGGTAQ92696 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGGTAQ92696 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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