Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCSTNQ92542 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCSTNQ92542 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCSTNQ92542 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms