Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGB4Q8WW32 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB4Q8WW32 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGB4Q8WW32 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB4Q8WW32 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms