Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSC4DQ8WTU2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSC4DQ8WTU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSC4DQ8WTU2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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