Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 1,601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RAPGEF6Q8TEU7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAPGEF6Q8TEU7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
RAPGEF6Q8TEU7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RAPGEF6Q8TEU7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RAPGEF6Q8TEU7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
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