Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC8Q8TC99 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC8Q8TC99 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC8Q8TC99 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms