Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGBL3Q8NEM8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGBL3Q8NEM8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
AGBL3Q8NEM8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGBL3Q8NEM8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGBL3Q8NEM8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGBL3Q8NEM8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGBL3Q8NEM8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGBL3Q8NEM8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGBL3Q8NEM8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AGBL3Q8NEM8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AGBL3Q8NEM8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms