Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE6

FBXL13, F-box/LRR-repeat protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL13Q8NEE6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXL13Q8NEE6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXL13Q8NEE6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXL13Q8NEE6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms