Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF248Q8NDW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF248Q8NDW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF248Q8NDW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms