Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIBP2Q8ND30 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIBP2Q8ND30 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms