Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP0

TTC13, Tetratricopeptide repeat protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13Q8NBP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC13Q8NBP0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC13Q8NBP0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC13Q8NBP0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms