Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD12Q8N8I0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD12Q8N8I0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms