Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T3

ARFGAP1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARFGAP1Q8N6T3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP1Q8N6T3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms