Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RYBPQ8N488 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RYBPQ8N488 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RYBPQ8N488 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RYBPQ8N488 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms