Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC43Q8N309 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms