Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLGN4XQ8N0W4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLGN4XQ8N0W4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms