Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y01

DTX1, E3 ubiquitin-protein ligase DTX1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX1Q86Y01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX1Q86Y01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX1Q86Y01 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX1Q86Y01 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms