Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4Q86W47 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4Q86W47 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms