Protein–RNA interactions for Protein: Q86U38

NOP9, Nucleolar protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP9Q86U38 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP9Q86U38 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP9Q86U38 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP9Q86U38 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms