Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPOR1Q6ZS17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RIPOR1Q6ZS17 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR1Q6ZS17 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms