Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ULK3Q6PHR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK3Q6PHR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK3Q6PHR2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms