Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFWD3Q6PCD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFWD3Q6PCD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms