Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
C9orf84Q5VXU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
C9orf84Q5VXU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms