Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXM1

CDCP2, CUB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP2Q5VXM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP2Q5VXM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCP2Q5VXM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms