Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF9Q5VWM5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF9Q5VWM5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms