Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGSNQ5TDP6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms