Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIVEP3Q5T1R4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIVEP3Q5T1R4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms