Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
C1orf220Q5T0J3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf220Q5T0J3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms