Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAT1Q5SQI0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAT1Q5SQI0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms