Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRPB2Q5JXA9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIRPB2Q5JXA9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRPB2Q5JXA9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms