Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCID2Q5JVF3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCID2Q5JVF3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms