Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC178Q5BJE1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC178Q5BJE1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC178Q5BJE1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC178Q5BJE1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms