Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP100Q494V2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP100Q494V2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP100Q494V2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms