Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ECM1Q16610 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM1Q16610 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ECM1Q16610 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM1Q16610 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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