Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRNP35Q16560 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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