Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NTRK3Q16288 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NTRK3Q16288 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
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