Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX2Q14781 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX2Q14781 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX2Q14781 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX2Q14781 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX2Q14781 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX2Q14781 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX2Q14781 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX2Q14781 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms