Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMC1AQ14683 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMC1AQ14683 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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